Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcfQ61164 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CtcfQ61164 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms