Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cln3Q61124 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cln3Q61124 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cln3Q61124 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms