Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mkrn3Q60764 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mkrn3Q60764 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms