Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb6Q60692 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms