Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a4Q5XF90 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a4Q5XF90 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp13a4Q5XF90 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms