Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a3Q5XF89 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a3Q5XF89 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp13a3Q5XF89 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278 ms