Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms