Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znrf3Q5SSZ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znrf3Q5SSZ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms