Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme4Q5SSW2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psme4Q5SSW2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psme4Q5SSW2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms