Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgap44Q5SSM3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap44Q5SSM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap44Q5SSM3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms