Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
5730522E02RikQ5SP45 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms