Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc1Q5NCF2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc1Q5NCF2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms