Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rtl5Q5DTT4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl5Q5DTT4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms