Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx49Q4FZF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx49Q4FZF3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms