Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf38aQ4FK66 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf38aQ4FK66 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.6 ms