Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam228bQ497Q6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam228bQ497Q6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam228bQ497Q6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam228bQ497Q6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms