Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Carmil2Q3V3V9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil2Q3V3V9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil2Q3V3V9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms