Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnpc3Q3UZ01 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms