Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTA9

Eif4e1b, Eukaryotic translation initiation factor 4E type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4e1bQ3UTA9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif4e1bQ3UTA9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Eif4e1bQ3UTA9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eif4e1bQ3UTA9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms