Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk3Q3U3Q1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ulk3Q3U3Q1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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