Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fam172aQ3TNH5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam172aQ3TNH5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam172aQ3TNH5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam172aQ3TNH5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam172aQ3TNH5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms