Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc10Q3TLI0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc10Q3TLI0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms