Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43aQ3TL54 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim43aQ3TL54 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43aQ3TL54 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms