Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdlim7Q3TJD7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdlim7Q3TJD7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdlim7Q3TJD7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms