Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd11Q1RNF8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd11Q1RNF8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samd11Q1RNF8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms