Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp4r2Q0VGB7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp4r2Q0VGB7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp4r2Q0VGB7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms