Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc138Q0VF22 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc138Q0VF22 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms