Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pate4Q09098 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pate4Q09098 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms