Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah2Q06986 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah2Q06986 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms