Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINDOCQ05AH6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINDOCQ05AH6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms