Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sox12Q04890 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sox12Q04890 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sox12Q04890 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sox12Q04890 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms