Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1Q04750 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1Q04750 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top1Q04750 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top1Q04750 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top1Q04750 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms