Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nucb1Q02819 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb1Q02819 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nucb1Q02819 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nucb1Q02819 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nucb1Q02819 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nucb1Q02819 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nucb1Q02819 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nucb1Q02819 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nucb1Q02819 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nucb1Q02819 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nucb1Q02819 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nucb1Q02819 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms