Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Htr1fQ02284 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htr1fQ02284 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms