Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl1Q02067 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl1Q02067 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms