Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apoa1Q00623 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoa1Q00623 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms