Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pitx2P97474 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx2P97474 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pitx2P97474 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms