Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cmklr1P97468 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmklr1P97468 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cmklr1P97468 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms