Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh10P70408 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh10P70408 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh10P70408 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdh10P70408 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdh10P70408 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh10P70408 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.9 ms