Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema3eP70275 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3eP70275 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms