Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2bP62915 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2bP62915 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms