Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps11P62281 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps11P62281 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps11P62281 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps11P62281 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps11P62281 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms