Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhbdl3P58873 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdl3P58873 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rhbdl3P58873 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhbdl3P58873 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhbdl3P58873 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhbdl3P58873 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhbdl3P58873 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms