Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp5P56399 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp5P56399 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp5P56399 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp5P56399 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp5P56399 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp5P56399 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp5P56399 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms