Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmc4P54775 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmc4P54775 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms