Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cux1P53564 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux1P53564 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cux1P53564 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cux1P53564 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cux1P53564 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux1P53564 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux1P53564 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cux1P53564 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cux1P53564 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cux1P53564 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cux1P53564 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cux1P53564 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cux1P53564 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms