Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Map3k1P53349 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Map3k1P53349 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Map3k1P53349 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Map3k1P53349 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms