Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr1P51675 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr1P51675 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.8 ms