Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Csrp3P50462 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrp3P50462 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrp3P50462 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms