Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod1P49813 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmod1P49813 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod1P49813 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms